2022年7月19日にSlackが発表した、プロプランの値上げとフリープランの内容変更は大きな衝撃を与えました。特に、後者の無料版Slackのメッセージ上限が、1万通→過去90日以内に変更すること…

Over the past year, we‘ve fundamentally changed how we produce graphics.

Nature Communications - All DNA/RNA nucleobases were identified in carbonaceous meteorites. Having been provided to the early Earth as a component in carbonaceous meteorites, these molecules might...

A classification of chart types based on their input data format.

ChatGPT 人間のフィードバックから強化学習した対話AI - Download as a PDF or view online for free

ChatGPT is attracting a cross-field interest as it provides a language interface with remarkable conversational competency and reasoning capabilities across many domains. However, since ChatGPT is...

EMアルゴリズムとともだちになろう

This document aims to be a self-contained, mathematically precise overview of transformer architectures and algorithms (*not* results). It covers what transformers are, how they are trained, what...

Cell type–dependent dynamic combinatorial code for motor representation in tuft dendrites of M1 layer 5 pyramidal neurons is discussed.

強化学習の基礎と深層強化学習（東京大学 松尾研究室 深層強化学習サマースクール講義資料） - Download as a PDF or view online for free

はじめに この記事では、当社内で開発した最適化フレームワークである「Codable Model Optimizer 」について紹介します。 リクルートでは

While deep learning has enabled tremendous progress on text and image datasets, its superiority on tabular data is not clear. We contribute extensive benchmarks of standard and novel deep learning...

はじめに本記事では，論文執筆やプレゼン発表の際にnegocia社内で参考にしている資料を @aiueola さんと一緒にまとめました．もし何かの参考になれば幸いです．(また，もし関連リソースをご…

今まで僕がデータサイエンス関連で勉強してきて、良かった教材や無料の教材をまとめました。今後もどんどん更新していきますので、保存してご活用ください！自己紹介データサイエンティストを目指して日々勉…

こちらの記事は随時追加更新していきます記事の内容何かと話題のChatGPTですが、今回はこのChatGPTをプログラミング学習として活用し、「最強の学習ツール」にしてしまおうという記事になりま…

本稿では、これまで独立に発展を遂げてきた次の3つの領域を組み合わせ、新しい生物学のあり方を模索する：（1）遺伝子を中心としたバイオインフォマティクス解析、（2）生態系における個体や種の情報を扱う生物多様性情報解析、（3）生物たるヒトが生み出した文化情報の解析。従来これらの分野では異なる学術体系に基づ …

A list of free online molecular biology tools for plasmid mapping, DNA and protein sequence analysis, primer design and more.

At The Check Up, we shared updates on our medical LLM research, partnerships and new ways AI can help with disease detection.

Nature Biomedical Engineering - Rejections are unwelcome. We seek to make them easier to understand.

2022.7.25 MIRU2022 チュートリアル講演「テンソル分解の基礎と応用」でのスライド資料になります。

はじめにこれからPython・機械学習を本格的に身に着けたい方コストをかけずに、お試しで学習してみたい方英語よりも、なるべく日本語の教材で勉強したい方以上の方に向けて溢れんばかりの無料のWe…

顕微鏡画像やトランスクリプトームといった生命科学データを題材に機械学習を学べる実践書．ダウンロードしたコードをブラウザで実行できるので，wet研究者でも今日から始められます．

　英国キングス・カレッジ・ロンドンが、パートナー企業やオープンソースのソフトウェアを活用して開発したAIモデルを用いて、脳の合成画像を10万枚生成しオープンソースとして公開すると発表した。AIを生成す

Nature Cancer - Authors may appeal negative editorial decisions. But should they? Here we discuss when an appeal is more or less likely to be successful and the dos and don’ts of the appeal...

Abstract. pH regulates protein function and interactions by altering the charge of individual residues causing loss or gain of intramolecular noncovalent b

Progress update: Our latest AlphaFold model shows significantly improved accuracy and expands coverage beyond proteins to other biological molecules, including ligands.

今回はモジュールをGoogle Drive上にインストールし、ノートブック上でパスを追加することで時間が経過してもモジュールを読み込めることが確認できたのでそれを紹介する。

In collaboration with the Metal engineering team at Apple, we are excited to announce support for GPU-accelerated PyTorch training on Mac. Until now, PyTorch training on Mac only leveraged the CPU,...

タンパク質を構成するアミノ酸配列からその安定な立体構造を予測することは、生命科学の研究において非常に重要な意味を持っている。このために多くの実験研究者は60年以上に渡って1つ1つのタンパク質の構造を決定し、計算科学者は30年以上もの間、立体構造予測の技術を進化させてきた。2020年11月30日にDe …

2022年6月8日にSSII 2022のチュートリアル講演で使用 2023年2月2日に順天堂大学産学連携講座：AI技術とビジネス活用で使用 2017年に機械翻訳を対象として提案されたTransformerは、従来の畳込みや再帰を排して自己注意機構を活用したニューラルネットワークです。2019年頃からコンピュータビジョン分野でも急速に応用が進んでいて、より柔軟かつ高精度なネットワーク構造として...

自然言語処理を中心に、データをベクトルで表現する埋め込み表現は、深層学習の基礎的な技術として盛んに研究されています。本記事では、歪んだ空間である双曲空間上のベクトルとしてデータを埋め込む手法である「双曲埋め込み (Hyperbolic Embeddings)」を紹介します。まず、双曲埋め込みの代表的な手法である Poincaré Embeddings について周辺技術から解説し、さらに双曲埋...

生体組織のゲノム情報を個々の細胞レベルで網羅的に計測し解析するシングルセル解析が可能となり、組織を構成する各細胞の挙動や多様な細胞種の性質について分析することができる。シングルセル解析においては、各細胞での遺伝子発現量（Single-cell RNA sequencing）と数理的手法とに基づいて、 …

Contribute to google-deepmind/educational development by creating an account on GitHub.

Large language models (LLMs) have demonstrated impressive capabilities in natural language understanding and generation, but the quality bar for medical and clinical applications is high. Today,...

Servier Medical Art provides you with thousands of professionally designed medical elements for your presentations and your scientific publications.

Nature Methods - This work presents a comprehensive benchmarking analysis of computational methods that integrates spatial and single-cell transcriptomics data for transcript distribution...

第18回愛媛大学DS研究セミナー

Nature Reviews Genetics - In this Review, the authors discuss the latest advances in profiling multiple molecular modalities from single cells, including genomic, transcriptomic, epigenomic and...

Nature Communications - Clustering is a powerful machine learning method for discovering similar patterns according to the proximity of elements in feature space. Here the authors propose a local...

Organizations rely on machine learning engineers (MLEs) to operationalize ML, i.e., deploy and maintain ML pipelines in production. The process of operationalizing ML, or MLOps, consists of a...

先日オンラインセミナーで交絡に関するレクチャーをしました。 合計1000人以上に参加していただき、ありがとうございました。 当日���講義資料を公開します。 交絡とは何か、どうやって調整変数を選ぶか、（観察データ分析をする限り必ず生じる）未調整交絡があるというシチュエーションでどのように結果を解釈するかなどについて話しまし…

Recent technological and algorithmic advances enable single-cell transcriptomic analysis with remarkable depth and breadth. Nonetheless, a persistent challenge is the compromise between the ability...

Abstract. Protein engineering is an emerging field in biotechnology that has the potential to revolutionize various areas, such as antibody design, drug di

Nature - A reinforcement learning approach based on AlphaZero is used to discover efficient and provably correct algorithms for matrix multiplication, finding faster algorithms for a variety of...

Nature Biotechnology - The go-ahead for Vertex’s gene editing therapy in sickle cell disease and β-thalassemia is a historic milestone, but this one-time treatment is costly.

2021年9月8日に開催された、Bio"Pack"athon 2021 #9の露崎 弘毅氏による「最短で習得するRパッケージ開発入門(前編)」をお送りします。 本講習では、Rパッケージを構成するファイルやディレクトリを理解しながら行う、Rパッケージ開発の仕方を紹介しています。 本トークは、丸善出版の「Rの基礎とプログラミング技法」を参考にしました。 この講演動画は、Bio”Pack”atho...

Python is a popular and widespread programming language for scientific computing, in large part due to the powerful array programming library NumPy, which makes it easy to write clean, vectorized and...

顕微鏡画像やトランスクリプトームといった生命科学データを題材に機械学習を学べる実践書．ダウンロードしたコードをブラウザで実行できるので，wet研究者でも今日から始められます．

Nature Methods - Spatial Omics DataBase (SODB) is a web-based platform for sharing and analyzing >25 types of spatial omics data. SODB promotes data reuse, offers novel visualization tools...

Brain-wide recordings and computational modeling in C. elegans reveal how the neurons across its nervous system encode its behavior.

Nature Methods - Cellpose 2.0 improves cell segmentation by offering pretrained models that can be fine-tuned using a human-in-the-loop training pipeline and fewer than 1,000 user-annotated regions...

Nature Communications - Deep learning has enabled advances in understanding biology. In this review, the authors outline advances, and limitations of deep learning in five broad areas and the...

Since its appearance in 2021, Alphafold2, an accurate protein structure prediction method, has quickly been adopted and substantially impacted biology …

(Image by wal_172619 from Pixabay)去年で恒例の推薦書籍リストの更新は一旦終了したつもりだったんですが、記事を公開して以降に「これは新たにリスト入りさせないわけにはいかない！」という書籍が幾つも現れる事態になりましたので、前言撤回して今年も推薦書籍リストを公開しようと思います。

Nature Methods - Dramatic advances in protein structure prediction have sparked debate as to whether the problem of predicting structure from sequence is solved or not. Here, I argue that...

Nature Biomedical Engineering - This Review discusses the advantages and limitations of self-supervised methods and models for use in medicine and healthcare, and the challenges in collecting...

Nature Medicine - Machine learning algorithms are a powerful tool in healthcare, but sometimes perform no better than traditional statistical techniques. Steps should be taken to ensure that...

Nature Methods - This Perspective discusses how machine learning can help in studying rare diseases using various emerging approaches.

R/Pharma is a nonprofit focused on delivering a scientifically & industry oriented, collegial event focused on the use of R in the development of pharmaceuticals. The conference covers topics...

Nature Reviews Methods Primers - Uffelmann et al. describe the key considerations and best practices for conducting genome-wide association studies (GWAS), techniques for deriving functional...

An example of how Ms-Excel can be deleterious in data science

Nature Reviews Genetics - In this Review, the authors discuss our latest understanding of the spatial aspects of cancer evolution, including the roles of cancer subclonal structure, tissue...

CVPR2022の全論文を読んで各要素200文字でまとめる挑戦の成果物です��